1、主要依据：
（1）好发于夏秋季节。
（2）以儿童为主要发病对象，常在婴幼儿聚集的场所发生，呈流行趋势。
（3）临床主要表现为初起发热，白细胞总数轻度升高，继而口腔、手、足等部位粘膜、皮肤出现斑丘疹及疱疹样损害。
（4）病程较短，大多孩子在1周内痊愈。
2、辅助检查：
（1）血常规：一般病例白细胞计数正常或偏高，分类时淋巴细胞较高，中性粒细胞较低。
（2）血生化检查：部分病例丙氨酸转氨酶、谷草转氨酶、肌酸激酶同工酶轻度升高。重症病例血糖可升高。
（3）脑脊液检查：外观清亮，压力增高，白细胞计数增多（危重病例多核细胞可多于单核细胞），蛋白正常或轻度增多，糖和氯化物正常。
（4）X线胸片：可以表现为双肺纹理增多，网络状、点片状、大片状阴影，部分病例以单侧为主，快速进展为双侧大片阴影。
（5）磁共振：以脑干、脊髓灰质炎损害为主。
（6）脑电图：部分病例可以表现为弥漫性慢波，少数可出现棘（尖）慢波。
（7）心电图：没有特异性改版，可以看到窦性心动过速或过缓，ST-T改变。
（8）病原学检测：
①病毒分离：自咽拭子或咽喉洗液、粪便或肛拭子、脑脊液或疱疹液及脑、肺、脾、淋巴结等组织标本中检测到肠道病毒核酸，并鉴定为肠道病毒71型、柯萨奇病毒A16型或其他肠道病毒。
②核酸检测：自病人血清、咽拭子或咽喉洗液、粪便或肛拭子、脑脊液或疱疹液及脑、肺、脾、淋巴结等组织标本中检测到肠道病毒核酸，并鉴定为肠道病毒71型、柯萨奇病毒A16型或其他肠道病毒。
③血清学检测：急性期与恢复期血清肠道病毒71型、柯萨奇病毒A16型或其他肠道病毒中和抗体有4倍或4倍以上升高。