1、从流行季节区分
甲型流感：一年四季均可发生，温带的秋季冬季发病率较高。
普通感冒：多发于秋季末期和冬春季节，特别是温差变化较大的天气。
2、从传染性区分
甲型流感：传播快、发病率高，传染率可达50%，由于人群缺乏免疫力，容易引起暴发或流行。
普通感冒：以散发为主，一般人在受凉、淋雨、过度疲劳后，因抵抗力下降，较容易发病。以单个病人出现，传染率低于10%。不会引起大流行。
3、从临床症状区分
甲型流感：最初出现类似普通流感症状，但体温突然超过39℃，肌肉酸痛感明显增强，伴随有眩晕、头疼、腹泻、呕吐等症状或其中部分症状，而呼吸道症状轻微或不明显。
普通感冒：全身中毒症状轻微，发热较低，但呼吸道症状明显，常以鼻咽部发干，打喷嚏开始，之后出现流涕、鼻塞等症状。
4、从愈后效果区分
甲型流感：儿童、老人、身体衰弱的恢复较慢，容易发生并发症，死亡率为0.51%，造成死亡的主要原因一是病毒来势凶猛，二是民众起初对新疾病不重视，以为是普通感冒，很多人自己随便吃些药，错过了发病初72小时的最佳救治期。
普通感冒：一般来说，如没有并发症，1周内可自愈，很少因感冒而危及生命。
5、从免疫力区分
患甲型H1N1流感后，比患普通感冒后产生的免疫力强，感染治愈后可维持2~4年，普通感冒后获得的免疫力较弱，因此，一个人在短期内可以反复患普通感冒。