1、消化器官未完全成熟。
由于1—2岁的宝宝生长发育特别迅速，所以，身体需要的营养及热能较多。然而，消化器官却未完全发育成熟，分泌的消化酶较少。因此，消化能力较弱，容易发生腹泻。
2、神经系统对胃肠的调节功能差。
由于神经系统对胃肠的调节功能差，所以饮食稍有改变，如对添加的离乳食品不适应、短时间添加的种类太多，或一次喂得太多、突然断奶；或是饮食不当，如吃了不易消化的蛋白质食物；气温低身体受凉加快了肠蠕动、天太热，消化液分泌减少及秋天温差大、小肚子易受凉等，都可引起腹泻。
3、全身及胃肠道免疫力较低。
由于全身及胃肠道免疫力较低，所以只要食物或食具稍有污染，便可引起腹泻；宝宝因抵抗力较低而易发生呼吸道感染，在患感冒、肺炎、中耳炎时，也常可引起腹泻。