1、影响孩子长高：发育迟缓患儿由于身体机能的发展限制，往往身高都比同龄人矮很多，这其中与先天遗传因素或宫内的发育不良有关，也可能是由于某些疾病，如染色体异常（唐氏综合征、特纳综合征）、代谢性疾病、骨骼疾病（骨软骨发育不全）、慢性疾病、慢性营养不良性疾病、内分泌疾病（如生长激素缺乏症、甲状腺功能低下症）等所引起的。
2、影响孩子言语和语言发育：患儿会出现出现言语和语言发育迟缓的现象。表现为语言发育迟缓，发音困难，构音不清，不能说成句的话，不能正确表达自己的意思，有的脑发育迟缓患儿完全失语。痉挛性四肢瘫，双侧瘫患儿也常伴语言障碍。
3、影响神经系统发育：羊角风或癫痫为患儿神经系统方面最常见的危害。发育迟缓程度越严重，并发羊角风或癫痫的机率就越高，这也增加了治疗难度。
4、影响智力：智力低下是最常见的脑发育迟缓危害。60%以上的发育迟缓患儿都存在智力低下的现象其中有25%的患儿甚至为重度智能落后，痉挛型四肢瘫及强直型脑发育迟缓者智能更差。
5、影响视力：据统计，25-50%的脑发育迟缓患儿都伴有视力障碍，患儿多表现为近视、弱视、斜视等。严重者有眼震，偶为全盲。
6、不利于孩子的心理健康成长：由于身高体重都比同龄，儿童偏低可能因此受到其他孩子的嘲笑，容易导致孩子不爱和生人接触、交流，缺乏自信。对孩子的心理造成一定的影响。
7、影响孩子的学习成绩：在发育时期内若出现智力发育迟缓，孩子的智力功能明显低于同龄水平，同时伴有适应性行同时伴有适应性行的缺陷，上课时注意力不易集中，严重影响孩子的学习。