首先，由于情绪紧张等原因导致孕妇月经推迟、排卵期错后、受孕时间晚，从而出现孕囊较实际停经天数小。
例如，停经50天，但检查中却发现孕囊仅有40天左右大小。这种孕囊偏小属正常情况，只要经一周动态检查显示绒毛膜促性腺激素及孕酮值正在逐渐增多，孕囊在继续生长，并且逐渐出现了胎芽和胎心，即说明孕囊偏小是由于排卵期错后、受孕时间晚等生理性原因所致，可继续妊娠。
其次，由于精子、卵子发育不良，孕妇在孕期感染支原体、衣原体、风疹病毒或孕妇在怀孕期间接触到有毒有害物质等原因，导致孕囊发育不良，小于正常月份。出现以上情况的孕妇在妊娠期随着时间的推移孕囊会继续长大，但见不到胎芽和胎心，这种情况下的孕囊是不健康的，最终会导致孕妇流产。