异位妊娠未发生流产或破裂时，临床表现不明显，诊断较困难，需采用辅助检查方能确诊。
异位妊娠流产或破裂后，诊断多无困难。如有困难应严密观察病情变化，若阴道流血淋漓不断，腹痛加剧，盆腔包块增大以及血红蛋白呈下降趋势等，都有助于确诊。还可采用以下检查方法协助诊断：
1、hCG测定：尿或血hCG对早期诊断异位妊娠至关重要。异位妊娠时，患者体内hCG水平较宫内妊娠低。连续测定血hCG，若倍增时间大于7日，异位妊娠的可能性较大;倍增时间小于1.4日，异位妊娠可能性极小。
2、孕酮测定：血清孕酮的测定对判断正常妊娠胚胎的发育情况有帮助。异位妊娠时，血清孕酮水平偏低，多数在10-25ng/ml之间。如果血清孕酮值>25ng/ml，异位妊娠几率小于1.5%;如果其值<5ng/ml，应考虑宫内妊娠流产或异位妊娠。
3、B超诊断：宫腔内未探及妊娠囊，若宫旁探及异常低回声区，且见胚芽及原始心管搏动，可确诊异位妊娠。若宫旁探及混合回声区，子宫直肠窝有游离暗区，虽未见胚芽及胎心搏动，也应高度怀疑异位妊娠。
将血hCG测定与超声检查相配合，对异位妊娠的诊断帮助很大。当血hCG>2000IU/L、阴道超声未见宫内妊娠囊时，异位妊娠诊断基本成立。
4、腹腔镜检查：腹腔镜检查时异位妊娠诊断的金标准，而且可以在确诊的同时行镜下手术治疗。但约有3%-4%的患者因妊娠囊过小而被漏诊，也可能因为输卵管扩张和颜色改变而误诊为一位妊娠，应予以注意。
5、阴道后穹窿穿刺：适用于疑有腹腔内出血的患者。腹腔内出血最易积聚于直肠子宫陷凹，即使出血量不多，也能经阴道后穹窿穿刺抽出血液。陈旧性异位妊娠时，可抽出小块或不凝固的陈旧血液。当无内出血、内出血量很少、血肿位置较高或直肠子宫陷凹有粘连时，可能抽不出血液，因此阴道后穹窿穿刺阴性不能排除输卵管妊娠。
需要注意的是，利用早孕试纸是无法检测出宫外孕的。早孕试纸通过检测人体hCG含量来判断是否妊娠，但无法判断出受精卵着床位置和着床情况。当女性发生宫外孕时，早孕试纸检测会呈阳性，建议女性发现自己怀孕后尽早通过B超和血hCG来进一步确诊。