市面上常见的有两种酸奶，一种为传统牛奶发酵制成的酸奶，另一种则是在前者的发酵基础上，添加了另外两种乳酸菌的酸奶，所以，常常会看到包装上印有“益生菌”字样的酸奶。益生菌不但可以调节肠道微生态的不平衡状态，使其趋于平衡，恢复和保持人体健康。还可以增强人体免疫力;促进肠道蠕动，帮助消化；抑制腐败菌的生长，降低肠道癌的危险，还能促进矿物质的吸收等。
传统酸奶是不含活性的乳酸菌的，但是也有很高的营养价值。因为在乳酸菌发酵过程中，消耗掉了乳糖，产生一系列的代谢产物如维生素类、酶类等，这些代谢产物对人体都是有益处的。而益生菌酸奶则含有活性乳酸菌，能产生一系列对人体有益的代谢产物，其含有的活性乳酸菌，还有利于调节人体肠道微生态的平衡。
一般来说，提到乳酸菌发酵酸奶，乳酸菌可以是活性的，也可以是非活性的;而益生菌酸奶的最大特点就在一个‘活’字上。益生菌需要在低温下才能保持活菌数量。